Die Universität Paderborn erhielt im Jahre 2009 den mit 100.000 Euro dotierten Genderpreis NRW für „Geschlechtergerechte Hochschulkonzepte“. Überreicht wurde der Preis vom Ministerium für Innovation, Wissenschaft, Forschung und Technologie des Landes Nordrhein-Westfalen.

Mit dem Genderpreis werden Hochschulen ausgezeichnet, die innovative Karrierekonzepte in Forschung und Lehre bieten und diese in der Praxis adäquat umsetzen. Bei der Auswahl ausgezeichneter Gleichstellungskonzepte an Universitäten werden nicht nur eingereichte Konzepte zur Verbesserung der Karrierechancen für Frauen berücksichtigt, sondern auch die bereits erzielten Fortschritte im Bereich der Gleichstellung.